Publicación científica | septiembre, 2021
Microbiota composition and susceptibility to florfenicol and oxytetracycline of bacterial isolates from mussels (Mytilus spp.) reared on different years and distance from salmon farms
La acuicultura chilena produce principalmente salmonídeos y moluscos. La producción de salmonídeos ha sido cuestionada por su uso excesivo de antimicrobianos. Este estudio tuvo como objetivo investigar la composición de la microbiota bacteriana de Mytilus spp. cultivados cerca de centros salmonídeos y determinar la concentración mínima inhibitoria (CMI) frente a florfenicol y oxitetraciclina de sus bacterias cultivables. Siete sitios de cultivo de Mytilus, clasificados según su proximidad a centros salmonídeos como cercanos (CSF) o distantes (DSF), fueron muestreados durante dos años. Analizamos la composición de la microbiota de Mytilus mediante métodos independientes de cultivo, y aislamos bacterias cultivables, identificando aquellos aislados con valores de CMI ≥ 64 μg mL⁻¹ para florfenicol u oxitetraciclina.
Los resultados revelaron que la diversidad alfa se vio afectada por el año de muestreo, pero no por la ubicación del sitio de cultivo de Mytilus ni por su interacción. No obstante, en 2018 se observó una correlación negativa significativa entre la diversidad alfa de la microbiota de Mytilus en cada sitio de cultivo y las toneladas de florfenicol reportadas para cada área de manejo fitosanitario. Se detectaron diferencias significativas en la diversidad beta y en la abundancia relativa de taxones bacterianos específicos en la microbiota de Mytilus, dependiendo de la proximidad a centros salmonídeos y del año. Se detectó una mayor proporción de aislados con valores de CMI ≥ 64 μg mL⁻¹ para ambos antibióticos en 2019 en comparación con 2018; sin embargo, no se detectaron diferencias significativas según la ubicación del sitio de cultivo de Mytilus. No obstante, en 2019, los aislados provenientes de sitios CSF mostraron valores de CMI más altos para ambos antibióticos que aquellos provenientes de sitios DSF. Los géneros bacterianos correspondientes a aislados con valores de CMI ≥ 64 μg mL⁻¹ representaron una baja proporción de la microbiota de Mytilus identificada mediante el enfoque independiente de cultivo, lo que refleja la necesidad de implementar nuevas metodologías en el estudio de la resistencia a los antimicrobianos. Estos resultados sugieren que la proximidad a centros salmonídeos y el año de muestreo influyen en la microbiota de Mytilus y en los valores de CMI de sus aislados bacterianos; sin embargo, otras variables ambientales deberían considerarse en estudios futuros.
